Preliminarmente puede plantearse que el estado de salud de los manglares en el territorio es satisfactorio; en algunos sitios puntuales se presentan afectaciones locales. Existen diferencias entre los valores de salinidad en la costa norte y sur de los cayos, desde Cayo Sabinal hasta Cayo Guillermo, esta diferencia se relaciona con la estructura y composición florística del manglar, dominando Rhizophora mangle al norte y Avicennia germinnans al sur. Los mayores valores de salinidad se encontraron en la bahía de Jigüey, con severas afectaciones a la vida marina y fetidez de los fondos, lo que sugiere la necesidad de acciones para disminuir la salinidad en esta bahía. Los mayores espesores de suelos se localizan asociados a los manglares de los canalizos, esteros y pasas. Existe una correspondencia entre el espesor del sustrato y la altura de la vegetación de manglar.

Actualmente se desarrollan, como objetivo de la II fase del proyecto Sabana-Camagüey (GEF/ PNUD, Cuba), estudios referentes al estado de salud de los manglares del archipiélago Sabana-Camagüey.

En el año 2002 se concluyó el primer estudio de caso sobre resiliencia de manglares en Cuba, que se refiere a la capacidad de estos ecosistemas para enfrentar tensiones y para recuperarse cuando las tensiones disminuyen. El estudio se llevó a cabo en los manglares asociados al río Santa Ana, en el extremo NW de Ciudad de La Habana y constituye un esfuerzo por concretar la repercusión social de resultados científicos producidos en los campos de ecología y medio ambiente.

Para ello, se ha mantenido un sostenido intercambio de información entre el Instituto de Ecología y Sistemática (IES-CITMA), el Servicio Estatal Forestal (SEF-MINAGRI) y la Delegación del CITMA de Ciudad de La Habana. Se han empleando las bases de salud de ecosistemas, enfoques afines a investigaciones sobre cambios globales y de evaluación de impactos ambientales, para avanzar hacia una adecuada gestión de los manglares del territorio. Se logró la aprobación para el comienzo de la tramitación legal de una nueva área protegida, la cual debe servir como marco para compatibilizar la protección y uso de la diversidad biológica del territorio.

Para comunicar parte de los resultados científicos obtenidos, se ha tomado como base las relaciones entre los impactos ambientales que afectan los manglares, y se sugiere en la atenuación de cuáles pueden potencialmente incidir SEF y CITMA, lo cual se analizó a partir de su misión, objetivos, intereses y campo de acción. Este tipo de estudio y forma de intercambio de resultados puede contribuir a la interacción efectiva de los actores de la gestión ambiental de un territorio, haciendo énfasis en las posibilidades y necesidades de cooperación transectorial, transinstitucional y transdisciplinaria.